湖州市肛肠专科医院始建于1958年，是浙北、皖南、苏南地区一家以治疗肛肠疾病为主的有特色的专科医院。现有医疗用房5000平方米，床位110只，员工百余人，其中高级职称5人、中级职称30多人。
湖州市肛肠专科医院于2001年被湖州市卫生局批准为湖州市肛肠病治疗中心。肛肠外科于2001被列为市级重点学科建设项目。湖州市医学会肛肠专业委员会、湖州市中西医结合学会肛肠专业委员会挂牌、秘书长设在我院。
经过数十年的不懈努力，在采用中西医结合治疗肛肠疾病方面积累了丰富的临床经验。以疗效高、痛苦少，远期疗效好而赢得了海内外患者的广泛赞誉。精湛的技术，优良的服务，使得病人络绎不绝。年门诊量4万多人次，年手术在1500人次在右。业务量占全省同类专科之最。1997年投资近千万元建成了新的医院大楼，大楼宽敞、明亮、舒适。内设电视、电话系统，监护系统。低、中、高档病房一应齐全。
随着卫生事业的不断改革和深化，为适应新的形势需要，湖州市肛肠专科医院领导班子注重内涵建设，提高全体职工的整体素质，狠抓医德医风为主体的职业道德建设，实行竞聘上岗和末位淘汰制，推出一系列便民措施，实行公开承诺制，成立消费者监督联络站，并聘请社会监督员，接受各界人士的监督，为医院赢得了良好的社会声誉。以"创一流服务、争一流技术、育一流人才、树一流医风"为目标，竭诚为广大人民的健康事业服务。